Bon comme je me suis lancé sur les schémas de montages des systèmes hi-fi embarqués, je peut au moins répondre à une partie de ces questions (mais j'ai pas la science infuse et peut me tromper

).
La source (l'auto-radio) : meilleur est la qualité de celui-ci en sortie, meilleur le rendu sera sur vos enceintes/caisson etc... Pour une bonne qualité d'écoute, et en fonction de vos envies/besoins, il doit disposer des 4 sorties HP standard, de prises RCA de sortie (spécialisées pour le SUB ou non, c'est précisé sur le mode d'emploi et l'emballage en générale), d'un lecteur CD/DVD,de prises RCA d'entrée (pour le changeur CD ou autres sources externes), la prise en charge du MP3,WMA, RAW (enfin plus de types de fichiers il connait mieux c'est pour vous mais la qualité dépendra de votre "encodage").
Pour les fichiers MP3, WMA et RAW, pensez à vérifier la plage de fréquences d'encodage supportée ; par exemple, il supportera de 66 à 390 Hz en MP3 donc si le fichier est encodé en 50 Hz (qualité pourrie mais économique en place) il ne pourra pas le lire tout comme un fichier encodé en 392 Hz ou plus(qualité ultra

).
Dans les options que je trouvent utiles (au niveau son seulement), on peut noter : l'égaliseur, la sélection de la plage de fréquences envoyée aux HP ("hight pass actif"), la plage de fréquences envoyée aux connexion RCA SUB ("low pass actif").
Notons qu'une source envoyant un mauvais signal ne donnera jamais rien de bon même avec les meilleures enceintes connectées dessus

.
Pour les HP : chacun aura ces préférences mais bien choisies toutes les enceintes peuvent avoir un excellent rendu. Il existe les kits éclatés où les fréquences sont "dispatchées" vers les différents éléments via des filtres actifs ou passif (selon les modèles) ou les HP multi-voix où là, les fréquences ne sont répartie que via des filtres passifs intégrés (de petites résistances).
A chaque type sont avantage, les kits répartissent un peu mieux les fréquences vers les éléments (même à partir des "milieux de gamme") mais demandent plus de place pour être intégrés au véhicule. Les HP multi-voix eux s'intègrent facilement dans les emplacements d'origine de la voiture mais ne donneront de bon résultats de séparation de fréquence qu'à partir du "milieu de gamme +" (pas le milieu de gamme mais un peu au dessus mais pour ce type préféré le haut de gamme).
La plage de fréquences envoyée par la source à ces HP peut être réglée via l'option de "hight pass actif" afin d'amélioré encore le signal et donc la qualité du son (les HP n'auront alors plus qu'à répartir une plage de fréquences moins importante et "forceront" donc moins sur le filtrage ; pas de risque de se retrouver avec des basses fréquences dans les tweeters

).
On prendra des HP ayant des Watts RMS supérieures à celles de la source afin de ne pas abimer leurs membranes (éléments qui se détériorent avec l'âge et provoquent des grésillements lorsqu'elles sont en fin de vie)
Les tweeters : Ce sont de petites enceintes prévues pour les fréquences allant de 12000 à 20000 Hz généralement. Leur différence se fera au niveau de leur plage de fréquences et dans leur durée de vie (ils ont tendance à être les premier à "cramer") qui dépend surtout du filtrage que l'on leur donne (via un filtre passif ou actif) et de la matière de leur "cône" (et non plus membrane). La matière du cône influe sur la qualité du rendu des aigües ; les cône en soie sont au top mais fatiguent vite alors que les cônes en titane ont un rendu moyen (à mon sens) mais dureront plus longtemps.
Les amplis : de même que les HP, à chaque type de fréquence son ampli. Pour un ampli alimentant des HP, on prendra du "class A,B ou C (en dernier recours)". Par contre si vous alimenté un SUBWOOFER (communément abrégé "SUB") préféré un ampli de "class D" qui ne gère que les basses fréquences (de 20 à 200 Hz).
Pour la puissance, prenez en un qui soit en dessous de la puissance du SUB sinon, risque de détériorer la membrane de celui-ci.
Comme pour les HP, la plage de fréquences (déjà filtrée par les RCA SUB de la source si existantes) peut être affinée par l'option "low pass actif" de la source.
Les caissons : à choisir en fonction de la taille du SUB mais, la plus aprt du temps, on achète un caisson de basses déjà équipé du subwoofer ce qui limite la possibilité de faire une erreur de calcul dans le choix du volume de "la caisse de résonance". Il existe plusieurs types de caissons comme les "bass-reflex", les "caisson clos", les "caissons ouverts", les "fait main" (

heu ceux là sont à proscrire sauf si vous connaissez les lois de la physique des ondes sonores

et que vous savez calculer le volume du caisson en fonction de la taille et de la puissance de votre SUB

).
Les "
bass-reflex" offrent un "boom" sonore et qui à tendance à se prolonger légèrement mais reste bien net si plusieurs "boom" se suivent. (NdlR : mes préférés

)
Les "
caissons clos" eux, ont tendance à couper le "boom" dès qu'il à été joué ce qui nous donne des basses très sèches et nettes (un peu comme Tampax

). Idéal pour la techno par exemple.
Pour les "
caissons ouverts", il s'agit des "standards" avec "l'évent" ou une ouverture calculée pour évacuer la pression d'air générée par le mouvement brusque de la membrane du SUB. Le "boom" sera ici plus commun bien qu'amplifié par rapport à des HP. Personnellement, je trouve qu'ils ont tendance à saturer assez vite dès qu'on atteint un certain seuil sonore mais pour une écoute en "douceur", ils suffisent à avoir un bon rendu des basses.
On peut obtenir un très bon son juste avec 4 enceintes (mais tapé dans les hauts de gamme, c'est plus sûr là) et une bonne source. Après, on peut y rajouter un petit SUB avec ampli (intégré ou non, les deux existe) et une paire de tweeter (avec un filtre c'est mieux). Cela donne déjà une bonne base hi-fi embarquée.
Pour ce qui concerne les grésillements, je dirai juste que cela peu provenir de différents "problèmes". Mauvaise isolation sonore du véhicule (qui fait caisse de résonnance dès qu'on monte le son), signal de la source pas au top (mauvaise source, mauvais cablage), présence de cablage électrique (de forte intensité) à proximité du cablage stéréo (d'où l'intérêt de tirer les lignes "d'alim" de l'ampli SUB à l'opposé du cablage RCA), mauvaise fixation des HP, etc...
Espérant ne pas avoir dit trop d'anneries et avoir aidé ceux qui le souhaitaient.
PS : je ne met pas de marques de hp/source, SUB, ampli, etc.... car chacun peu choisir sa marque préféré ou sélectionner celle qui correspondra le mieux au style de musique qu'il écoute. Toutes les infos sont donnée pour des milieux de gamme (le bas de gamme

ça donne rarement quelque chose de bien sauf exception).